Caractérisation d’un mutant de Bacillus cereus résistant aux endolysines.

La contamination d’un aliment par Bacillus cereus peut engendrer une altération de ses qualités organoleptiques, de sa durée de conservation ou encore représenter un risque pour sa sécurité sanitaire. Le développement de nouvelles stratégies permettant de détecter ou de contrôler B. cereus constitue donc un enjeu important pour la maîtrise de la chaîne alimentaire. Les endolysines, enzymes produites par les bactériophages et capables de dégrader le peptidoglycane bactérien, constituent des outils prometteurs pour le développement de nouvelles stratégies de détection et de contrôle de B. cereus. Dans le cadre du projet ANR BCLysin, un criblage d’une banque de mutants obtenue par transposition a permis d’identifier plusieurs mutants présentant une résistance accrue aux endolysines. Parmi les gènes identifiés, un gène codant pour une arginyl-ARNt synthétase (ArgS), enzyme impliquée dans le chargement des ARNt avec l’arginine, a été sélectionné pour une caractérisation approfondie. Un mutant propre correspondant, ΔargS, a été construit. L’objectif de ce stage sera de caractériser le phénotype du mutant ΔargS et de déterminer les mécanismes pouvant expliquer sa résistance aux endolysines. Le stagiaire étudiera notamment les propriétés de surface et certains caractères physiologiques du mutant, tels que l’hydrophobicité, la mobilité, la formation de biofilm et la sensibilité aux antibiotiques. Une attention particulière sera portée à l’étude de la réponse stringente, afin de déterminer si l’altération de l’arginyl-ARNt synthétase entraîne une perturbation de l’homéostasie des acides aminés et une activation de cette réponse. En parallèle, un transcriptome comparatif du mutant et de la souche sauvage à différents stades de croissance est actuellement en cours. Les résultats attendus fin 2026 permettront d’identifier les voies biologiques et les gènes dont l’expression est modifiée chez le mutant et d’orienter les expériences complémentaires. Ces analyses pourront notamment conduire à étudier plus précisément certaines voies métaboliques ou des modifications de la surface bactérienne susceptibles de contribuer à la résistance aux endolysines. Ce stage permettra ainsi d’aborder une problématique à l’interface entre microbiologie, physiologie bactérienne, biologie moléculaire et caractérisation des interactions entre bactéries et enzymes antimicrobiennes. Equipe : SporAlim, SQPOV (Sécurité et qualité des produits d’origine végétale)   INRAE Avignon Centre PACA, route de l’Aérodrome, CS 40509, 84914 Avignon Cedex 9 https://www6.paca.inrae.fr/sqpov/Equipes-Personnes/SporAlim