Caractérisation et évaluation de la surveillance intégrée des Escherichia coli pathogènes pour l'Homme dans une perspective One Health

Le projet de thèse vise à caractériser et évaluer la surveillance des Escherichia coli pathogènes pour l'Homme en France dans une perspective One Health. Il part du constat que de nombreux dispositifs, sectoriels et éclatés, produisent des données hétérogènes sur E. coli (sécurité sanitaire des aliments, santé humaine, santé animale, environnement), dont la complémentarité et l'intégration sont encore peu exploitées pour la décision publique. La question centrale est : comment la structure des dispositifs de surveillance des E. coli pathogènes pour l'Homme en France conditionne-t-elle leur performance, et quels leviers permettraient d'améliorer leur intégration et leur efficacité ? Le projet se décline en trois volets. Le volet 1 consiste en une caractérisation des dispositifs de surveillance programmée et évènementielle d'E. coli en France, depuis la coordination nationale jusqu'au niveau opérationnel (y compris des données sanitaires produites). Le volet 2 évalue le niveau d'intégration One Health des dispositifs, à partir d'un outil d'évaluation standardisé semi quantitatif (OH-EpiCap) et des entretiens semi-directifs afin d'analyser les collaborations intersectorielles (avec l'approche EcoSur), ainsi que les logiques d'acteurs et les freins à la circulation et au partage des données (par une approche de sociologie des organisations). Le volet 3 vise à évaluer et comparer la performance et l'efficience des plans de surveillance et de contrôle (PSPC) des E. coli productrices de shigatoxines (STEC) le long de la chaîne alimentaire en France. L'évaluation portera sur la sensibilité des dispositifs, leur couverture (par comparaison avec les données RASFF et de retrait-rappel), ainsi que sur les ressources mobilisées et les coûts associés. Le projet s'inscrit dans un partenariat de recherche international (collaborations avec Sciensano en Belgique et le Federal Institute for Risk Assessment (BfR) en Allemagne) et vise à produire des recommandations opérationnelles pour le Ministère français de l'Agriculture et de l'Alimentation et les partenaires européens sur le pilotage de la surveillance des STEC et, plus largement, sur la mise en œuvre concrète de l'approche One Health. École doctorale : E2M2 - Evolution Ecosystèmes Microbiologie Modélisation Direction : Viviane HENAUX Financement : Programmes ministériels spécifiques