Ingénieur scientifique contractuel / Biologie et santé, Sciences de la vie, Epidémiologie/ Approches stochastiques /

Type de contrat : CDD Contexte et atouts du poste Dans le cadre d’un partenariat avec IGN et le CRESS dans le cadre du programme Jumeau NUmérique National (JUNN, cas d'usage prioritaire Simulation d'épidémies), l'équipe-projet ASCII (Inria, CNRS, Ecole polytechnique) porte le développement du simulateur ICI de propagation d'épidémies. ICI est un simulateur individu-centré de propagation des épidémies. Il construit un jumeau numérique d’un territoire et de sa population, à partir de données géographiques, démographiques et socio-professionnelles, puis simule les déplacements, interactions et contaminations entre individus. Le premier prototype a été construit sur les données de la COVID-19. A ce jour, les descripteurs de la population du jumeau numérique n’intègrent pas les maladies chroniques des individus. L’objectif de ce poste est d’identifier les principales maladies chroniques à ajouter au simulateur et à établir un pipeline, utilisant les données du SNDS pour fournir des indicateurs agrégés, par unité de lieu de la fréquence de ces maladies par âge et sexe afin de mieux définir la population synthétique. La personne recrutée complétera ces analyses par des revues systématiques et, lorsque pertinent, par l’analyse de données publiques. Elle contribuera à transformer ces résultats en travaux scientifiques publiables et en indicateurs utilisables par les acteurs de santé publique. Le recrutement renforcera ainsi la capacité de l’équipe METHODS à conduire des recherches sur la distribution territoriale des maladies chroniques et les conséquences des épidémies. https://ici.saclay.inria.fr/ Mission confiée Sous la direction du professeur Viet-Thi Tran (CRESS) et en collaboration avec d'autres professeurs du CRESS, la personne recrutée sera amenée à : Mission principale : Evaluer la fréquence des maladies chroniques, par unité géographique définie, augmentant le risque d’infection et de sévérité des infections à transmission aériennes. Pour une meilleure connaissance du sujet de recherche proposé et du simuleur ICI de propagation d'épidémies : https://ici.saclay.inria.fr/ Collaboration : La personne recrutée travaillera en lien étroit avec l'équipe-projet ASCII et avec Maxime Colomb (IGN) qui est le responsable du développement logiciel du simulateur ICI Principales activités Descriptif des activités : • Quantification des risques d’infection et de la sévérité de l’infection en fonction des maladies chroniques des personnes. Il ou elle estimera les probabilités d’infection, d’hospitalisation conventionnelle ou en réanimation et de décès selon l’âge, le sexe et les maladies chroniques, notamment pour la grippe et la COVID-19. Cette recherche utilisera une recherche de la littérature et/ou exploitera les données du SNDS • Estimation de la prévalence des maladies chroniques. À partir du Système national des données de santé (SNDS), il ou elle estimera la prévalence des maladies chroniques associées à un risque d’infection accru ou d’une sévérité accrue de la maladie par âge, sexe et unité géographique. Il ou elle définira les algorithmes d’identification, préparera les bases et produira des indicateurs reproductibles. Travail collaboratif avec l’équipe INRIA pour implémenter les résultats dans le simulateur ICI. Encadrement : Oui (épidémiologistes et biostatisticiens de l’équipe) Compétences Compétences techniques et niveau requis : Langues : Français et Anglais Compétences relationnelles : travail pluridisciplinaire  Compétences additionnelles appréciées : programmation, traitements statistiques de données Inria, l'institut national de recherche dans les sciences et technologies du numérique, est en appui de l’État pour les stratégies nationales de recherche et d’innovation du numérique en tant qu'Agence de programmes. Inria mène plus de 300 projets de recherche et d’innovation avec ses 3500 scientifiques, ingénieurs et personnels d’appui, en partenariat avec les universités et l’écosystème numérique (entreprises, entrepreneurs, acteurs publics). Ensemble, nous explorons des domaines clés comme l'intelligence artificielle, la cybersécurité, l’informatique quantique, le Cloud, la transformation numérique de la santé, les jumeaux numériques ou encore les technologies numériques pour la défense. Nous construisons des solutions concrètes telles que des logiciels, des startups technologiques, des partenariats avec les entreprises du tissu national et des formations de pointe. Notre objectif : l’impact scientifique, technologique et industriel au service de la souveraineté numérique de la France.