Interactions entre l'architecture du génome et les R-loops dans le cancer du poumon et la réponse aux traitements

Au cours du développement tumoral et en réponse à la pression thérapeutique, les cellules cancéreuses remodèlent profondément l'organisation épigénétique et structurelle de leur génome. Ce projet de thèse vise à étudier les interactions entre les R-loops, des structures alternatives des acides nucléiques, et l'organisation nucléaire du génome dans les cellules de cancer du poumon, et à déterminer comment des altérations de ces interactions contribuent à la réponse aux thérapies ciblées. Nous étudierons en particulier comment la déstabilisation des domaines associés à la lamina (LADs, pour Lamina-Associated Domains), de régions génomiques qui interagissent avec la lamina nucléaire et contribuent à l'organisation du génome, obtenue par la perturbation ciblée de composants majeurs impliqués dans leur ancrage, affecte les R-loops et l'organisation du génome. Nous déterminerons ensuite les conséquences de ces altérations sur la régulation de l'expression génique, l'instabilité génomique et l'inflammation dans les cellules de cancer du poumon. Enfin, nous étudierons si les altérations de l'organisation et de la structure des LADs affectent la réponse des cellules de cancer du poumon aux traitements anticancéreux et contribuent aux mécanismes de résistance thérapeutique. École doctorale : BSB - Biologie, Santé, Biotechnologies Direction : Agnese CRISTINI Financement : MSCA COFUND BEST